简介
药物-药物副作用很少在药物开发过程中直接测试。 我们的系统可以使用图机器学习在计算机上生成药物-药物相互作用的指示。
概述
在药物开发过程中使用图机器学习识别药物相互作用和潜在副作用。
借助 TigerLily，预测药物间的相互作用
TigerLily 是一个基于 TigerGraph 的系统，旨在解决药物相互作用预测任务。 在这个机器学习任务中，我们想要预测两种药物是否存在不良相互作用。 我们的框架允许我们在以下步骤中使用图挖掘技术来解决这个高度相关的现实世界问题：
- 使用 PyTigergraph，我们创建了药物和蛋白质的异构生物图；
- 我们在TigerGraph Cloud 中计算药物节点的个性化 PageRank 分数；
- 我们使用个性化 PageRank 矩阵的稀疏非负矩阵分解来嵌入节点；
- 使用节点嵌入，我们训练了一个基于梯度提升的药物相互作用预测器。
